Generell können Sie in den "Einstellungen" konfigurieren wann TheBest Minimize to Tray Fenster minimieren soll.
Manchmal kann es aber sinnvoll sein für einzelne Programme davon abzuweichen. Dazu gibt es die Ausnahmen. Diverse typische Ausnahmen sind vordefiniert, außerdem gibt es noch die Benutzerdefinierten Ausnahmen, die alle weiteren Fälle abdecken.